Articles in international scientific journals with  referee  practice  (SCI-Expanded ,  SSCI,  AHCI journals)

1. Asan, A., Ilhan, S., Sen, B., Erkara, I.P., Filik, C., Cabuk, A., Demirel, R., Ture, M., Okten, S.S. ve S. Tokur, “Airborne Fungi and Actinomycetes Concentrations in the Air of Eskisehir City (Turkey),” Indoor and Built Environment, 13, 63-74 (2004).

2.Akar, T., Cabuk, A., Tunali, S. ve M. Yamac, “Biosorption Potential of the Macro-Fungus Ganoderma carnosum for Removal of Lead(II) Ions from Aqueous Solutions,” Journal of Environmental Science and Health Part A Toxic/Hazardous Substance & Environmental Engineering, 41, 2587-2606 (2006).

3.Tunali, S., Çabuk, A. ve T. Akar, “Removal of Lead and Copper Ions from Aqueous Solutions by Bacterial Strain Isolated from Soil,” Chemical Engineering Journal, 115, 203-211 (2006).

4.Çabuk, A., Akar, T., Tunali, S. ve Ö. Tabak, “Biosorption Characteristics of Bacillus sp. ATS-2 Immobilized in Silica Gel for Removal of Pb(II),” Journal of Hazardous Materials, 136, 317-323 (2006).

5.Cabuk, A., Unal, A.T. ve N. Kolankaya, “Biodegradation of Cyanide by a White Rot Fungus, Trametes versicolor,” Biotechnology Letters, 28, 1313-1317 (2006).

6.Akar, T., Tunalı, S. ve A. Çabuk, “Study on the Characterization of Lead (II) Biosorption by Fungus Aspergillus parasiticus,” Applied Biochemistry and Biotechnology, 136, 389-405 (2007).

7.Çabuk, A., Akar, T., Tunali, S. ve S. Gedikli, “Biosorption of Pb(II) by Industrial Strain of Saccharomyces cerevisiae Immobilized on the Biomatrix of Cone Biomass of Pinus nigra: Equilibrium and Mechanic Analysis,” Chemical Engineering Journal, 131, 293-300 (2007). 

8.Gönen T.F., Yamac, M., Cabuk, A. ve Z. Yıldız, “Selection of Newly Isolated Mushroom Strains for Tolerance and Biosorption of Zinc In Vitro," Journal of Microbiology and Biotechnology, 18, 483-489 (2008).

9.Aytar P., Şam M., ve A. Çabuk, “Microbial Desulphurization of Turkish Lignites by White Rot Fungi, “Energy & Fuels, 22(2), 1196-1199 (2008).

10.Tunalı, A.S., Akar, T., Çabuk A., Decolorization of a Textile Dye, Reactive red 198 (RR198), by Aspergillus parasiticus fungal biosorbent, Brazilian journal of Chemical Engineering, 26(2), 299-405 (2009).

11.Tunalı, A.S., Akar, T., Kaynak, Z., Anilan, B., Cabuk, A., Tabak, Ö., Demir, T.A., Gedikbey T., Removal of Copper(II) Ions from Synthetic Solution and Real Wastewater by the Combined Action of Dried Trametes versicolor cells and montmorillonite, Hydrometallurgy, 97(1-2), 98-104 (2009).

12.Ozel, Y.K., Gedikli, S., Aytar, P., Unal, A., Yamac, M., Çabuk, A., Kolankaya N., “New fungal biomasses for cyanide biodegradation” Journal of Bioscience and Bioengineering, 110(4), 431-435 (2010).

13.Gedikli, S., Aytar, P., Ünal, A., Yamaç, M., Çabuk, A., Kolankaya N., Enhancement with inducers of laccase production by some strains and application of enzyme to dechlorination of 2,4,5–trichlorophenol, Electronic Journal of Biotechnology, 13 (6), 6-7(2010).

14.Şaşmaz, S., Gedikli, S., Aytar, P., Güngörmedi G., Çabuk, A., Ünal A., Kolankaya N., Decolorization potential of some reactive dyes with crude laccase and laccase mediated system, Applied Biochemistry and Biotechnology, 163 (3), 346-361 (2011).

15.Aytar, P., Gedikli, S., Şam, M., Ünal, A., Çabuk, A,  Kolankaya, N, Yürüm A., Desulphurization of Some Low-rank Turkish Lignites with Crude Laccase Produced from Trametes versicolor ATCC 200801, Fuel Processing Technology, 92 (1), 71-76 (2011).

16.Çabuk, A., Sıdır, Y.G., Aytar, P., Gedikli, S., Sıdır, I., Dechlorination of chlorinated compounds by Trametes versicolor ATCC 200801 crude laccase and quantitative structure–activity relationship of toxicity, Journal of Environmental Science and Health Part A, 47,1938-1947 (2012).

17.Bireller, E.S., Aytar, P., Gedikli, S., Cabuk A., Removal of some reactive dyes by untreated and pretreated Saccharomyces cerevisiae, alcohol fermentation waste, Journal of Scientific & Industrial Research, 71, 632-639 (2012).

18.Aytar, P., Gedikli, S., Sam M., Farizoglu B., Çabuk A., Sequential treatment of olive oil mill waste water with adsorption, biological and photo-Fenton oxidation, Environmental Science and Pollution Research, 20(5), 3060-3067 (2013).

19.Çabuk A., Aytar P., Gedikli S., Özel YK, Kocabıyık E., Biosorption of acidic textile dyestuffs from aqueous solution by Paecilomyces sp. isolated from acidic mine drainage, Environmental Science and Pollution Research, 20, 4540-4550 (2013).

20.Özçelik B., Aytar P., Gedikli S., Yardımcı E., Çalışkan F., Çabuk A., Production of an alkaline protease using Bacillus pumilus D3 without inactivation by SDS, its characterization and purification, Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemsitry, 29, 388-396 (2014)

21 .Aytar P, Kay CM., Mutlu MB, Çabuk A., Coal Desulfurization with Acidithiobacillus ferrivorans, from Balya Acidic Mine Drainage, Energy & Fuels, 27 (6), 3090–3098 (2014).

22.Aytar P., Gedikli S., Buruk Y., Çabuk A., Burnak N., Lead and Nickel Biosorption with a Fungal Biomass Isolated from Metal Mine Drainage: Box-Behnken Experimental Design, International Journal of Environmental Science Technology, 11, 1631-1640 (2014).

23. Aytar P., Oz Aksoy D., Toptas Y., Çabuk A., Koca S., Koca H.,  Isolation and characterization of native microorganism from Turkish lignite and usability at fungal desulphurization, Fuel, 116, 634-641 (2014).

24. Saraç N., Uğur A., Şimşek Ö., Aytar P., Toptaş Y., Buruk Y., Çabuk, Burnak A., Phenol tolerance and optimization of biodegradation by Serratia marcescens NS09-1 using Plackett-Burman design and Box-Behnken design, Environmental Engineering and Management Journal, accepted, (2014).

25. Cengiz G., Aytar P., Şam M., Çabuk A., Removal of reactive dyes using magnetically separable Trametes versicolor cells as a new composite biosorbent, Separation Science and Technology, 49, 1860-1871 (2014)

26. Gedikli S., Aytar P., Buruk Y., Apohan E., Çabuk A., Yesilada O., Burnak N., Laccase production and dye decolorization by Trametes versicolor: Application of Taguchi and Box-Behnken Methodologies, Turkish Journal of Biochemistry, 39, 298-306 (2014).

27. Oz Aksoy D., Aytar P., Toptaş Y., Çabuk A., Koca S., Koca H., Physical and physicochemical cleaning of lignite and the effect of cleaning on biodesulfurization, Fuel, 132, 158-164 (2014).

28. Akan T., Çabuk A., Indirect plasma inactivation by a low temperature atmospheric pressure plasma (LTAPP) system, Journal of Electrostatics, 72, 218-221(2014)

29. Güngörmedi, G., Demirbilek, M., Mutlu, M.B., Denkbaş, E.B., Çabuk, A., “Polyhydroxybutyrate and  Hydroxyvalerate Production by Bacillus megaterium Strain A1 Isolated from Hydrocarbon-Cantaminated Soil” Journal of Applied Polymer Science, 131,15, 1-8 (2014)

30. Aytar P., Kay C.M., Mutlu M.B., Çabuk A., Johnson D.B., Diversity of acidophilic prokaryotes at two acid mine drainage sites in Turkey, Environmental Science and Pollution Research, 22,5995-6003 (2014)

31. Yalçın E., Gedikli S., Çabuk A., Karahaliloğlu Z., Demirbilek M., Bayram C., Şam M., Sağlam N., Denkbaş EB., Silk fibroin/nylon-6 blend nanofilter matrix for copper removal from aqueous solution, Clean Technologies and Environmental Policy, 17, 921-934 (2015)

32- Aytar P., Bozkurt D., Erol S., Özdemir M., Çabuk A., Increased Removal of Reactive Blue 72 and 13 Acidic Textile Dyes by Penicillium ochrochloron Fungus Isolated from Acidic Mine Drainage,  (2016)

33.Çabuk A, Gedikli S., Aytar P., Çelikdemir M., Color removal of reactive textile dyes from aqueous solution by raw and modified fungal biosorbent, Environmental Engineering and Management Journal, accepted, 14, 10 (2015).

34.Toptaş Y., Çelikdemir M., Tuncer C., Buruk Şahin Y., Aytar Çelik P., Burnak N., Çabuk A., Bütün V., Optimization of a biosurfactant production from bacteria isolated from soil and characterization of the surfactant, Turkish Journal of Biochemistry, 2016, 41 (5), 338–346.

35. Koca, S., Aksoy, D. O., Cabuk, A., Celik, P. A., Sagol, E., Toptas, Y., ... & Koca, H. (2017). Evaluation of combined lignite cleaning processes, flotation and microbial treatment, and its modelling by Box Behnken methodology. Fuel, 192, 178-186.

36.Çakmak, H., Güngörmedi, G., Dikmen, G., Çelik, P. A., & Çabuk, A. The True Methodology for Rhamnolipid: Various Solvents Affect Rhamnolipid Characteristics. European Journal of Lipid Science and Technology. 2017:119 1700002(1-11)

37. Erkan Ilik, Pınar Aytar Çelik, Yagmur Toptas, Ahmet Çabuk, and Tamer Akan, Applying on Bacillus Cereus of Low-Pressure and Low-Temperature Plasma Jet in a Postdischarge Chamber, IEEE TRANSACTIONS ON PLASMA SCIENCE, 2017, in press. 

Articles in international scientific journals with  referee  practice  (excluding SCI-Expanded, SSCI, AHCI journals

1.Çabuk, A. ve S. İlhan, “Cu2+ Removal in a Biosorption Column by Immobilized Bacterial Biomass,” The European Journal of Mineral Proccesing and Environmental Protection, Special Issue, Biotreatment & Biosorption II, 3, 67-74 (2003).

2.İlhan, S., Çabuk, A., Filik, C. ve F. Çalışkan, “Effect of Pretreatment on Biosorption of Heavy Metals by Fungal Biomass”, Trakya University Journal of Science, 5, 11-17 (2004).

3.Çabuk, A., İlhan, S., Filik, C. ve F. Çalışkan, “Pb2+ Biosorption by Pretreated Fungal Biomass”, Turkish Journal of Biology, 29, 23-28 (2005).

4.Akan, T., N. Ekem, Y. Akgun, A. Kiremitci, A. Cabuk, S. Pat ve G. Musa, “Plasma Sterilization Using The High Voltage Pulsed Discharge At Atmospheric Pressure,” Journal of Applied Sciences, 6, 1566-1570 (2006).

5.Gedikli, S., Tabak, Ö., Tomsuk, Ö. Ve A. Çabuk, “Effect of Microwaves on Some Gram Negative and Gram Positive Bacteria”, Journal of Applied Biological Sciences, 2, 67-71 (2008).

6.Özşölen F., Aytar P., Gedikli S., Çelikdemir M., Ardıç M., Çabuk A., Enhanced production and stability of laccase using some fungi on different lignocellulosic materials, Journal of Applied Biological Sciences, 4 (3) 69-78 (2011).

7.Demir A., Aytar P., Gedikli S., Çabuk A., Arısoy M., Laccase production with submerged and solid state fermentation: Benefit and cost analysis, Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, 39(3) 305-313 (2011).

8.Benli E., Gedikli S., Aytar P., Güngörmedi G., Çabuk A., Dehalogenation and Detoxification Of 2,4-Dichlorophenol with Induced Laccase, IUFS Journal of Biology, 70(2) 25-34 (2011).

9.Aytar  P.,  Gedikli  S.,  Çelikdemir  M.,  Uzuner  S.,  Farizoğlu  B.,  Şam  M.,  Çabuk  A.,  Sağlam  N.,Dephenolization of olive mill wastewater by growing cells of some white rot fungi without adaptation, Turkish Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, 39 (4) 379-390 (2011).

10.Akbulut M., Aytar P., Gedikli S., Çabuk A., Trametes versicolor Lakkazı ile 2-Klorofenolden Klor Uzaklaştırılması, Sigma Mühendislik ve Fen Bilimler Dergisi, 30(1) 9-19 (2012).

11.Çabuk A., Kolankaya N., Siyanürün toksisitesi ve biyolojik yıkımı,  Sigma Mühendislik ve Fen Bilimler Dergisi, 30, 20-38 (2012).

12. Toptaş Y., Akca G., Çabuk A., Lactic acid production by Lactobacillus brevis isolated from oral microbiota, IUFS Journal of Biology, 2014, 73(1): 1-7.

13. Extremely, thermostable, EDTA-resistant alkaline protease from thermophilic Geobacillus subterraneus C2-1 isolate,  Yardımcı Akkar E., Buruk Şahin Y.,  Gedikli S., Aytar Çelik P.,  Çabuk A. , Journal of Microbiology, Biotechnology and Food Sciences, 2017, 7:50-56.

14. Sabancı, Şenay, et al. "Mikrokristalin selüloz ve odun unu ilaveli polihidroksibütirat (phb) kompozitlerinin solvent yöntemiyle hazırlanması ve karakterizasyonu."  Journal of Bartin Faculty of Forestry. (2017): 19 (1): 123-131.

15. Katar, Ş., Erol, S., Çelik, P. A., Özdemir, M., & Çabuk, A. (2017). Talaromyces aculeatus from acidic environment as a new fungal biosorbent for removal of some reactive textile dyes. Anadolu University Journal of Science and Technology A- Applied Sciences and Engineering. 18 (2): 521-534.

Articles in national scientific journals with referee practice

1.İlhan, S., Filik, C. ve A. Çabuk, “Yaş ve Kuru Fungus Miselleriyle Kurşun Biyosorpsiyonu Üzerine pH’ın Etkisi”, Anadolu Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi, 4, 27-34 (2003).

2.Çabuk, A., Akar, T., Kotluk, Z. Ve S. Şaşmaz, “Saccharomyces cerevisiae Hücreleri ile Ağır Metal Giderimi ve Metal Toleransı”, Orlab On-Line Mikrobiyoloji Dergisi, 5, 1-7 (2007).

3.Tabak, Ö., Gedikli, S., Aytar, P., Ünal A., Çabuk, A. ve N. Kolankaya, Trametes versicolor Lakkazı ile Pentaklorofenol ve 2,6-Diklorofenol’den Klor Uzaklaştırılması, Elektronik Mikrobiyoloji Dergisi TR, 7, 13-23 (2009).

4.Güngörmedi G., Şaşmaz S., Aytar P., Gedikli S., Ünal A., Çabuk A., ve N. Kolankaya, Trametes versicolor biyokütlesi ile Reaktif Red 198 Boyarmaddesinin Biyosorpsiyonu, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi, 22(2), 247-264 (2009).

5.Gedikli S., Aytar P., Ünal A., Çabuk A., Kolankaya N., Lakkaz enzimi ile kot boyarmaddesinin biyolojik yıkımı, Anadolu University Journal of Science and Technology –C Life Sciences and Biotechnology, 1(1) 59-70 (2010).

6.Ünal, A., Çabuk, A., Kolonkaya, N., Laboratuar ölçekli biyoreaktörde Trametes versicolor’dan elde edilen serbest ve immobilize lakkaz ile 2,4,6-trichlorophenol’den klor uzaklaştırılması, Anadolu University Journal of Science and Technology-C Life Sciences and Biotechnology, 1(2) 113-124 (2011).

7.Çelikdemir M., Gedikli S., Aytar P., Güngörmedi G., Çabuk A., Mikrodalganın Maya Hücrelerinin Canlılığı Üzerine Etkisi, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi, 24(2), 1-9 (2011).

8.Aytar P., Mutlu M.B., Çabuk A., Çan asidik maden drenaj gölünün bakteriyel çeşitliliğinin 16S klonlama yöntemi ile belirlenmesi: Temsili klon kütüphanesi, Elektronik Mikrobiyoloji Dergisi TR, 2013, 11, 19-27.

9.Aytar P., Buruk Y., Çabuk A., Streptecoccus equi ile hyaluronik aist üretiminde optimum koşulların Plackett-Burman yöntemi ile belirlenmesi, Elektronik Mikrobiyoloji Dergisi TR, 2013, 11, 28-35

International Written Books or Book Sections 

1. Saglam N, Yesilada O, Çabuk A, Sam M, Saglam S, Ilk S, Emul E, Aytar P, Gurel E, Innovation of Strategies and Challenges for Fungal Nanobiotechnology  Eds: Prasad R., Advances and Applications Through Fungal Nanobiotechnology, 2016, Springer International Publishing, Switzerland.

Papers presented oral and  published as  fulltext at  international congresses,  symposium, panel discussions, workshops, scientific, artistic meetings

1.P. Aytar, Y. Toptaş, D. Öz Aksoy, A. Çabuk, S. Koca, H. Koca, Microorganism isolation from lignites itself of Mihalıççık Koyunağılı province and usability of these isolates at biodesulphurization of lignite, XIII. International Mineral Processing Symposium, Bodrum, (2012).

2. Aytar P., Toptaş Y., Sağol E., Oluklulu E., Aksoy D.Ö., Çabuk A., Koca S., Koca H., Biodesulphurization as a complement to flotation for cleaning coal, XVII. International Coal Preparation Congress, İstanbul, 2013.

Uluslararası kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel, sanatsal toplantılarda sözlü olarak sunulan ve özet metin olarak yayımlanan bildiri.

1.Aytar P., Demir A., Gedikli S., Çabuk A., and Arisoy M., Laccase production with submerged and solid state fermentation: benefit and cost analysis, Oral presentation, 1st European Congress of Applied Biotechnology together with 29th DECHEMA's Biotechnology Annual Meeting, Berlin, (2011).

2. Çabuk A., Güngörmedi G., Demirbilek M., Mutlu MB., Denkbaş EB., High Production and Characterization of Bioplastic from Halomonas organivorans DB4, Oral presentation, BioMicroWorld 2015, Barcelona, 2015.

Papers presented oral and published as abstract text at international congresses, symposium, panel discussions, workshops, scientific, artistic meetings

1.Ilhan S, Döner E, Çabuk A, Resistance of Some Aspergillus and Penicillium Species to Lead Concentration in Soil and Media, Biotechnology 2000 The World Congress on Biotechnology 11th Internatioal Biotechnology Symposium and Exhibition , Berlin, 3, S.:621, Dechema, Frankfurt (2000).

2.Çabuk A, Ilhan S,Removal of Copper Fixed-Bed Biosorption with Immobilized Bacillus subtilis, 12th International Biodeterioration and Biodegradation Symposium (Biosorption and Bioremediation III (14-18/07/2002), Prag, International Biodeterioration and Biodegradation , 53, S.:195283, Elsevier (2004).

3.Ilhan S, Çabuk A,Filik C, Çalışkan F, Effect of Pretreatment on Biosorption of Lead by Fungal Biomass, 12th International Biodeterioration and Biodegradation Symposium (Biosorption and Bioremediation III (14-18/07/2002)), Prag, International Biodeterioration and Biodegradation 53, S.:195283, Elsevier (2004).

4.Gönen F, Yamaç M, Çabuk A, Akar T, Tunalı S, Türkel S, In-Vitro Studies on Zinc Tolerance of Some Mushroom Strains, 4th International Congress Environmental Micropaleontology, Microbiology and Meiobenthology, Isparta, 82, ISEMMM (2004).

5.Çalışkan F, İlhan S, Filik C, Çabuk A, Effect of Pretreatment on the Biosorption of Copper (II) Ions by Fungal Biomass, 4th International Congress Environmental Micropaleontology, Microbiology and Meiobenthology, Isparta, 34, ISEMMM (2004).

6.Çabuk A, İlhan S, Filik C, Çalışkan F, Lead Biosorption by Pretreated Fungal Biomass, 4 International Congress Environmental Micropaleontology, Microbiology and Meiobenthology, Isparta, 31, ISEMMM (2004).

7- Çabuk A., Sidir Y.G., Aytar P., Gedikli S., Sidir İ., Dechlorination of chlorinated compounds by Trametes versicolor ATCC 200801 crude laccase and quantitative structure-activity relationship of toxicity, Poster presentation, 1st European Congress of Applied Biotechnology together with 29th DECHEMA's Biotechnology Annual Meeting, Berlin, 2011.

8- Aytar P., Toptaş Y., Sağol E., Oluklulu E., Aksoy D.Ö., Çabuk A., Koca S., Koca H., Biodesulphurization as a complement to flotation for cleaning coal, XVII. International Coal Preparation Congress, İstanbul, 2013.

9- Ülker, D., Tuncer, D., Baker, Ş.B., Toptaş, Y., Çabuk, A., Vural, B.,  Catalytic And Antibacterial Activity Of Multi-Responsive Microgels, Poster, 3rd Internetional Symposium on Controlled/Living Polymerization, Antalya, 2014.

10- Toptas Y., Aytar P., Aksoy DO., Oluklulu S., Çabuk A., Koca S., Koca H., Biological and physical cleaning of Çayırhan lignites (Turkey), Poster presentation, BioMicroWorld 2015, Barcelona, 2015.

11-  Aytar P., Aksoy DO., Toptas Y., Oluklulu S., Çabuk A., Koca S. Koca H., Investigation of Çayırhan lignite biodesulphurization of microoganisms isolated from coal itself, Poster presentation, BioMicroWorld 2015, Barcelona, 2015.

Papers presented oral and published as fulltext at national congresses, symposium, panel discussions, workshops, scientific, artistic meetings

1.Şaşmaz S., S. Gedikli, P. Aytar, G. Güngörmedi, A. Çabuk, A. Ünal, N. Kolankaya, Lakkaz ve lakkaz aracılı sistemler kullanılarak bazı boyarmaddelerin dekolorizasyonu- Sözlü bildiri, 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, 2009.

2.Gedikli S., Aytar P., Çelikdemir M., Ünal A., Yamaç M., Çabuk A., Kolankaya N., Çeşitli makrofungus izolatlarının lakkaz üretim yetenekleri açısından değerlendirilmesi-Sözlü bildiri, 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, 2009.

3.Aytar P., Gedikli S., Çelikdemir M., Uzuner S., Farizoğlu B., Şam M., Çabuk A., Bazı beyaz çürükçül funguslarla zeytin karasuyundan fenol giderimi-Sözlü bildiri, 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, 2009.

Papers presented oral and published as abstract text at  national congresses, symposium, panel discussions, workshops, scientific, artistic meetings.

1.İlhan, S., Çabuk, A., “Porsuk Çayı’nın Mevsimsel Olarak Fiziksel, Kimyasal ve Mikrobiyolojik İncelenmesi”, 15. Ulusal Biyoloji Kongresi, 48, Ankara, (2000).

2.Çabuk, A., İlhan, S., “İmmobilize Bakteriyal Biyokütle ile Atıksulardan Pb2+ Giderimi”, 16. Ulusal Biyoloji Kongresi, 37, Malatya, (2002).

3.İlhan, S., Filik, C., Çabuk, A., Çalışkan, F., “ Metarrhizium anisopliae var. anisopliae Biyokütlesinin Nikel Biyosorpsiyon Kapasitesi Üzerine Ön İşlemlerin Etkisi”, 17. Ulusal Biyoloji Kongresi, 5, Adana (2004). 

4.Çabuk, A., Akar, T., Tunalı, S., “Bacillus sp. Kullanılarak Sulu Çözeltilerden Pb2+ Uzaklaştırılması”, 5. Ulusal Kromatografi Kongresi, 85, Eskişehir (2004).

5.Çabuk, A., Ünal, A.T., Kolankaya, N., “Beyaz Çürükçül Funguslarla Siyanür Biyodegradasyonu”, 14. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 124-127, Eskişehir (2005).

6.Çabuk, A., Tabak, Ö., Alper, N., Akar, T., Tunalı, S., Kolankaya, N., “Trametes versicolor ATCC (200801)’dan Elde Edilen Eksopolisakkarit ile Pb (II) Uzaklaştırılması”, 14. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 136-140, Eskişehir (2005).

7.Özel YK, Cin M, Gedikli S, Aytar P, Çabuk A, Ünal A, Kolankaya N, Beyaz çürükçül funguslar ile siyanür içeren atık suyun iyileştirilmesi, 9. Ulusal Ekoloji ve Çevre Kongresi, Nevşehir, (2009).

8.Kutlu F, Gedikli S, Aytar P, Çelikdemir M, Çabuk A, Katı substrat fermentasyonu ile lakkaz, lignin peroksidaz ve mangan peroksidaz üretimi, 9. Ulusal Ekoloji ve Çevre Kongresi, Nevşehir, (2009).

9.Tabak Ö, Aytar P, Gedikli S, Ünal A, Çabuk A, Kolankaya N, Trametes versicolor’dan elde edilen lakkaz enzimi ile bazı klorofenolik bileşiklerin deklorinasyonu, 9. Ulusal Ekoloji ve Çevre Kongresi, Nevşehir, (2009).

10.Aytar P., Gedikli S., Yıldırım S., Yardımcı E., Oduncu E., Farizoğlu B., Çabuk A., Zeytin kara suyunun fenol gideriminde ardışık montmorillonitle adsorpsiyon ve biyolojik işlemin kullanılması, Sözlü sunum, X. Ekoloji ve Çevre Kongresi, Çanakkale, (2011).

11.Çelikdemir M., Buruk Y., Burnak N., Çabuk A.,Biyosürfektan Üretici Bir İzolat İçin Plackett Burman İstatistiksel Analiz Yöntemi İle Besiyeri Bileşenlerinin Optimizasyonu, Sözlü Sunum, 21. Uluslararası katılımcı Ulusal Biyoloji Kongresi, İzmir, (2012).

12. Sunguroğlu C., Sezgin DE., Çelik PA., Çabuk A., Hyaluronik Asit Sentaz Geninin Lactococcus lactis’de Ekspresyonu, Sözlü sunum, 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya, (2015)

13. Çakmak H., Güngörmedi G., Demirbilek M., Çelik PA.,  Çabuk A., Pseudomonas aeruginosa’dan Rhamnolipid Üretimi ve Karakterizasyonu, Sözlü sunum, 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya, (2015)

14. Korkmaz F., Sönmez GD, Çelik PA., Çabuk A., Mutlu MB., Yüksek Bor İçerikli Maden Toprağının Mutajenite ve Genotoksisitenin Ames/Salmonella, Muta-Chromoplate ve RAPD-PCR Yöntemleriyle Araştırılması, Sözlü sunum, 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya, (2015)

15. Toptaş Y., Öz Aksoy D., Aytar Çelik P., Koca S., Koca H., Çabuk A. Biyomadencilik uygulamalarında kullanılabilecek endüstriyel mikroorganizmalar, Sözlü Sunum, 23. Ulusal Biyoloji Kongresi, Gaziantep, (2016)

Papers presented oral and poster at national congresses, symposia, panel discussions, workshops, scientific, artistic meetings

1.İlhan, S., Filik, C., Çabuk, A., “Yaş ve Kuru Fungus Miselleriyle Kurşun Biyosorpsiyonu Üzerine pH’nın Etkisi”, 12. Biyoteknoloji Kongresi, 48, Balıkesir (2001).

2.Çabuk, A., İlhan, S., “İmmobilize Bacillus subtilis ile Sıkıştırılmış Yatak Biyoreaktörde Cu2+ Giderimi ve Geri Kazanımı”, 13. Biyoteknoloji Kongresi, 129, Çanakkale (2003).

3.Çabuk, A., Tunalı, S., Akar, T., “Bakteriyal Biyokütle ile Cu2+ Biyosorpsiyonu için Optimum Koşulların Belirlenmesi”, 5. Ulusal Kromatografi Kongresi, 145, Eskişehir (2004).

4.Akar, T., Çabuk, A., Kotluk, Z., Tunalı, S., “Serbest ve İmmobilize Saccharomyces cerevisiae Hücreleri ile Ağır Metal İyonlarının Uzaklaştırılması”, 1. Ulusal Afinite Teknikleri Kongresi, 67, Ankara, (2005).

5.Çabuk, A., Kotluk, Z., Şaşmaz, S., Tunalı, S., Akar, T., “Saccharomyces cerevisiae Hücrelerinin Katı ve Sıvı Besiyerinde Cu2+Dirençliliği ve Biyosorpsiyon ile İlişkilendirilmesi”, 14. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 528, Eskişehir (2005).

6.Kızılcık, M., Yamaç, M., Çabuk, A., “Bazı Makrofungus İzolatlarının Farklı Besiyerlerinde Eksopolisakkarit Üretim Potansiyeli”, 14. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 566, Eskişehir, (2005).

7.Akar, T., Çabuk, A., Tunalı, S., “Bacillus sp. Biyokütlesi ile Pb2+ ve Cu2+ İyonlarının Biyosorpsiyon Mekanizmasının Araştırılması”, 19. Ulusal Kimya Kongresi, 443, Aydın, (2005).

8.Çabuk, A., Yamaç, M., Öztürk, N., Erkara, İ.P., “Vitex agnus-castus L. Eksrelerinin Antimikrobiyal Aktivitesi”, 18. Ulusal Biyoloji Kongresi, 221-222, Aydın, (2006).

9.Çabuk, A., Tunalı, S., Akar, T., Yamaç, M., “Ganoderma carnosum Pat. Fungal Biyokütlesi ile Pb2+ Giderimi”, 18. Ulusal Biyoloji Kongresi, 230-231, Aydın, (2006).

10.Çabuk, A., Akar, T., Tunalı, S., Tabak, Ö., “Silika Jelde İmmobilize Bacillus sp. ATS-2 Biyokütlesi ile Sıkıştırılmış Yatak Biyoreaktörde Pb2+ Giderimi”, 18. Ulusal Biyoloji Kongresi, 231, Aydın, (2006).

11.Akar, T., Tunalı, S., Çabuk, A., “Aspergillus parasiticus Biyokütlesi ile Sulu Çözeltilerden Pb2+ İyonunun Biyosorpsiyonu”, 3. Ulusal Analitik Kimya Kongresi, 199, Çanakkale, (2006).

12.Kaynak, Z., Tunalı, S., Akar, T., Çabuk, A., Demir, T.A., Gedikbey, T., “T. versicolor Tutturulmuş Kil ile Cu2+ İyonlarının Adsorpsiyon Şartlarının Araştırılması”, 3. Ulusal Analitik Kimya Kongresi, 50, Çanakkale,(2006).

13.Kaynak, Z., Tunalı, S., Akar, T., Çabuk, A., Tabak, Ö., Demir, T.A., Gedikbey, T., “T. versicolor Tutturulmuş Kil ile Cu2+ İyonlarının Sulu Çözeltilerden Uzaklaştırılmasında Atomik Absorpsiyon Spektroskopisinin Kullanımı”, 10. Ulusal Spektroskopi Kongresi, 130, İzmir, (2007).

14.Aytar P, Çabuk A, Phanerochaete chrysosporium ile linyit kömüründen kükürt giderimi, 7. Ulusal Ekoloji ve Çevre Kongresi, Malatya, (2007).

15.Tunalı Akar S, Akar T, Çabuk A, Decolorization of a textile dye, Reactive Red 198 (RR198), by Aspergillus parasiticus fungal biosorbent, XXII. Ulusal Kimya Kongresi, Kıbrıs, (2008).

16.Akar T, Çabuk A, Tunalı S, “FTIR, SEM/EDX Teknikleri Kullanılarak Aspergillus parasiticus Biyokütlesi ile Kurşun(II) İyonlarının Biyosorpsiyon Mekanizmasının Araştırılması” 4. Ulusal Afinite Teknikleri Kongresi, Muğla, (2008).

17.Aytar  P,  Çabuk  A,  Trametes  versicolor  ile  Linyit  Kömüründen  Kükürt  Giderimi,  19.  Ulusal  Biyoloji Kongresi, Trabzon, (2008).

18.Gedikli S, Aytar P, Güngörmedi G, Benli E, Çabuk A, Lakkaz enzimi ile kot boyar maddesinin biyolojik yıkımı, 9. Ulusal Ekoloji ve Çevre Kongresi, Nevşehir, (2009).

19.Aytar P, Gedikli S, Çelikdemir M, Şam M, Ünal A, Çabuk A, Kolankaya N, Trametes versicolor’dan elde edilen lakkaz ile düşük kaliteli linyit kömürlerinden kükürt uzaklaştırılması, 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi,Antalya, (2009).

20.Özel YK, Gedikli S, Aytar P, Çelikdemir M, Ünal A, Çabuk A, Kolankaya N, Çeşitli makrofungus izolatlarının siyanür yıkım yeteneklerinin araştırılması, 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, (2009).

21.Özel YK, Gedikli S, Aytar P, Çabuk A, Ünal A, Kolankaya N, Trametes versicolor, Phanerochaete chrysosporium ve Pleurotus sajor-caju biyokütleleri ile kurşun, nikel ve çinko biyosorpsiyonu, 20. Ulusal Biyoloji Kongresi, Denizli, (2010).

22.Güngörmedi G, Şaşmaz S, Aytar P, Gedikli S, Ünal A, Çabuk A, Kolankaya N, Trametes versicolor biyokütlesi ile Reaktif Red 198 boyarmaddesinin biyosorpsiyonu, 20. Ulusal Biyoloji Kongresi, Denizli, (2010).

23.Çelikdemir M, Gedikli S, Aytar P, Ünal A, Çabuk A, Kolankaya N, Mikrodalganın Maya ve Bakteri Hücrelerinin Canlılığı üzerine etkisi, 20. Ulusal Biyoloji Kongresi, Denizli, (2010).

24.Girgin M, Özçelik B, Gedikli S, Aytar P, Ünal A, Çabuk A, Kolankaya N., İmmobilize Saccharomyces cerevisiae hücrelerinin Dylon Navy 17 biyosorpsiyonunda Kullanılabilirliği, 20. Ulusal Biyoloji Kongresi, Denizli, (2010).

25.Gedikli S, Aytar P, Ünal A, Yamaç M, Çabuk A, Kolankaya N, Trametes versicolor lakkazı ile 4-klorofenol ve 2,4,5-triklorofenolden klor uzaklaştırılması, 20. Ulusal Biyoloji Kongresi, Denizli, (2010).

26.Gedikli S., Aytar P., Özel Y.K., Çelikdemir M., Güngörmedi G., Çabuk A.,Asidik maden drenajından izole edilen fungal biyokütle ile Blue 72, Orange 13 ve Violet 1 tekstil boyarmaddelerinin renk gideriminin araştırılması, Poster sunum, X. Ekoloji ve Çevre Kongresi, Çanakkale, (2011).

27.Çelikdemir M., Çabuk A., Hidrokarbon kirliliği olan topraklardan izole edilen mikroorganizmların biyosürfektan üretim yeteneklerinin araştırılması, Poster sunum, X. Ekoloji ve Çevre Kongresi, Çanakkale,(2011).

28.Toptaş Y., Uğur N., Çiper PB., Çabuk A., Hatay iline ait zeytinyağların antibakteriyel aktivitesinin araştırılması, Poster sunum, X. Ekoloji ve Çevre Kongresi, Çanakkale, (2011).

29.Cengiz G., Toptaş Y., Çabuk A., Şam M., Manyetik nanopartikül (Fe3O4) yüklü Trametes versicolor biyokütlesi ile Reaktif Blue 13, Yellow 85, Violet 1 boyarmaddelerinin biyosorpsiyonu, Poster Sunum, 21. Uluslararası katılımcı Ulusal Biyoloji Kongresi, İzmir, (2012).

30.Çabuk A., Gedikli S., Aytar P., Çelikdemir M., Kimyasal olarak modifiye edilmiş fungal biyosorbentle reaktif tekstil boyarmaddelerinden renk giderimi, Poster sunum, 21. Uluslararası katılımcı Ulusal Biyoloji Kongresi, İzmir, (2012).

31. Aytar P., Bozkurt D., Erol S., Özdemir M., Çabuk A., Asidik maden drenajından izole edilen Penicillium ochrochloron ile bazı asidik tekstil boyar maddelerin gideriminin optimizasyonu, Poster sunum, 22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, (2014).

32. Gedikli S., Aytar S., Buruk Y., Apohan E., Çabuk A., Yesilada Ö., Burnak N., Trametes versicolor ile lakkaz üretimi ve renk giderimi: Taguchi ve Box Behnken Yöntemlerinin Uygulanması, Poster sunum, 22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, (2014).

33.Toptaş Y., Erdönmez O., Katar Ş., Kavak D., Çabuk A., Kimyasal Olarak Modifiye Edilmiş Saccharomyces cerevisiae biyokütlesi ile kurşun giderimi, Poster sunum, 22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, (2014).

34.Yardımcı E., Çabuk A., Potansiyel termofilik proteaz üreticisi izolat ile üretim koşullarının optimizasyonu, Poster sunum, 22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, (2014).

35.Yıldırım S., Çabuk A., Hidrokarbon kirliliği bulunan topraklardan izole edilen mikroorganizmalardan mikrobiyal pigment üretimi, Poster sunum, 22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, (2014).

36. Gungormedi G., Çakmak H., Sunguroğlu C., Mutlu MB., Çabuk A., Halofilik Arke ve Bakterilerin Poli-β-hidroksibütirat Üretim Yeteneklerinin Belirlenmesi, Poster sunum, 22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, (2014).

37. İlhan S., Kocabıyık Y.E., Dağ İ., Aytar P., Gedikli S., Asidik Çevrelerin Bir Üyesi Talaromyces aculeatus: Türkiye İçin İlk Kayıt, Poster sunum, 1.Ulusal Mikoloji Günleri, Erzurum (2014).

38. Bozkurt D., Çelik PA., Sönmez GD, Mutlu MB, Korkmaz F., Çabuk A., Bor İçeren Çevresel Örneklerden Bakteri İzolasyonu ve Elde Edilen İzolatların Bor Toleranslarının Belirlenmesi, Poster sunum, 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya (2015)

39. Erol S.,  Katar Ş., Çelik PA., Çabuk A., Özdemir M., Tekstil Endüstrisinde Kullanılan Reaktif Boyarmaddelerin Adsorpsiyon Kinetiğinin İncelenmesi, Poster sunum, 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya (2015)

40. Katar Ş., Erol S., Çelik PA., Özdemir M., Çabuk A., Asidik Maden Drenajından İzole Edilen Taloromyces sp. ile Bazı Asidik Reaktif Boyarmaddelerin Biyosorpsiyonu, Poster sunum, 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya (2015)

41. Toptaş Y., Çelik PA., Gedikli S., Güngörmedi G, Sudağıdan M, Çökmüş C., Çabuk A., Öktem HA, Sivas Kangal Bölgesi Linyitlerinin Biyolojik Olarak İyileştirilebilirliği, Poster sunum, 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya (2015)

42. Güngörmedi G., Gedikli S., Toptaş Y., Çelik PA, Çabuk A., Öktem HA, Mezofilik ve Termofilik Bakterilerden elde edilen Proteazın Deterjan Uygulamalarındaki Kullanılabilirliği, Poster sunum, 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya (2015)

43. Gedikli S., Toptaş Y., Çelik PA., Güngörmedi G., Çabuk A., Öktem HA., Mikrobiyal Gübre Potansiyeli Olan Bakterilerin Eldesi, Poster sunum, 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya (2015)

44. Birhanlı E., Yeşilada Ö., Çabuk A. Çeşitli Tekstil Boyalarının Yeni İzole Edilmiş Bacillus megaterium İle Renginin Giderimi, Poster Sunum, 23. Ulusal Biyoloji Kongresi, Gaziantep, (2016).