Doktora Tezleri

1. AYTAR P., “Aşırı Asidik Ortamlarda Prokaryotik Çeşitliliğin Geleneksel ve Moleküler Yöntemlerle Belirlenmesi ve Biyodesülfürizasyonda Kullanılabilirliği”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2012 (Danışman: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
2. GEDİKLİ, S., “Sıcak Su Kaynaklarından Termofilik Mikroorganizmaların İzolasyonu, İdentifikasyonu, Poli b-hidroksibütirat Üretim Yeteneklerinin Belirlienmesi”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2016  (Danışman: PROF. DR. AHMET ÇABUK; DOÇ. DR. MEHMET BURÇİN MUTLU).
3. TOPTAŞ Y., “Asidofil Mikrobiyal Çeşitliliğin Belirlenmesi ve Biyomadencilik Uygulamalarında Kullanılabilirlikleri”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2016  (Danışman: PROF. DR. AHMET ÇABUK).
4. NURAL YAMAN B., "Asid Maden Drenaj Göllerindeki Prokaryotik Çeşitliliğin Geleneksel ve Moleküler Yöntemler ile Belirlenmesi ve Biyoteknolojik Uygulamaları", Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2019  (Danışman: PROF. DR. AHMET ÇABUK).
5. ÖZCAN YK., "Manyetik Fungal Biyokütle ile Boyar Madde Biyosorpsiyonu" Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2020  (Danışman: PROF. DR. AHMET ÇABUK).
6. MANGA EB., "Polihidroksibütirat üretimi için entegre multi-omik, mekanistik makina ögrenmesi ve CRISPR yaklaşımı" Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2022  (Danışman: DOÇ. DR. PINAR AYTAR  ÇELİK).
7. ERDAL ALTINTAŞ Ö., "Akut yaraların iyileştirilmesinde bitkisel lipozom içeren levan bazlı biyoaktif hidrojellerin geliştirilmesi" Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2023  (Danışman: DOÇ. DR. PINAR AYTAR  ÇELİK).
8. DOĞAN S., "Çörek otu (Nigella sp.) yağlarının fizikokimyasal-biyoaktif özelliklerinin incelenmesi, ve yağın ekmek eldesinde kullanılabilirliği " Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2022  (Danışman: DOÇ. DR. PINAR AYTAR  ÇELİK;PROF. DR. TEMEL ÖZEK).
9. YAVAŞ ES:, "Atmosferik soğuk plazmaların farklı tür planktonik bakteri ve biyofilmler üzerine etkilerinin incelenmesi " Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2024  (Danışman: PROF. DR. AHMET ÇABUK; PROF. DR. TAMER AKAN).

Yüksek Lisans Tezleri

1. AYTAR P., “Beyaz Çürükçül Funguslarla Linyit Kömüründen Kükürt Giderimi İçin Optimum Koşulların Belirlenmesi”, Balıkesir Üniversitesi, 2007. ( PROF. DR. BAYRAM YILDIZ ; İkinci danışman;YRD. DOÇ. DR. AHMET ÇABUK)
2. ÖZEL, Y.K., “Çeşitli Makrofungus İzolatlarının Siyanür Biyodegradasyon Yeteneği Açısından Değerlendirilmesi ve Optimum Koşulların Belirlenmesi”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2008 (DANIŞMAN: YRD. DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
3. TABAK, Ö., “Çeşitli Basidiomycetes İzolatları ile Klorofenolik Bileşiklerin Biyolojik Yıkımı”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2008 (DANIŞMAN: YRD. DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
4. GEDİKLİ, S., “Cesitli Makrofungus İzolatlarının Lakkaz Uretim Yetenekleri Acısından Değerlendirilmesi ve Dekolorizasyon Uygulamalarında Kullanılabilirliği”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2008 (DANIŞMAN: YRD. DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
5. ŞAŞMAZ, S., “Lakkaz ve Lakkaz Aracılı Sistemler Kullanılarak Boyarmadde Dekolorizasyonu”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2009 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
6. ÖZŞÖLEN, F., "Katı Faz Fermentasyonu ile Ligninolitik Enzimlerin Üretimi", Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2010 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
7. ÇEÇE, Ş., "Trametes versicolor Lakkazı ile 4-Klorofenolden Klor Uzaklaştırılması", Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2010 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
8. BENLİ, E., "Trametes versicolor Lakkazı ile 2,4-Diklorofenolden Klor Uzaklaştırılması", Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2010 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
9. BİRELLER, E.S., “Doğal ve Ön İşlem Uygulanmış Saccharomyces cerevisiae Biyokütleleri ile Sulu Çözeltilerdeki Bazı Tekstil Boyarmaddelerinin Renk Giderimi Koşullarının Araştırılması”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2011 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
10. GİRGİN, M., “Pinus nigra Kozalağı Üzerine İmmobilize Edilmiş Saccharomyces cerevisiae Biyokütleleri ile Sulu Çözeltilerdeki Bazı Tekstil Boyarmaddelerinin Renk Giderimi Koşullarının Araştırılması”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2011 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
11. TOPTAŞ, Y., “Ağız Mikrobiyotasından İzole Edilen Bakterilerin Laktik Asit Üretim Yeteneklerinin Araştırılması”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2011 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK; ÖĞR. GÖR. GÜLÇİN AKCA).
12. ÖZÇELİK B., “Hidrokarbonla Kirlenmiş Alanlardan İzole Edilen Bakterilerin Proteaz Üretim Yeteneklerinin Araştırılması”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2012 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
13. GÜNGÖRMEDİ G., “Hidrokarbonla Kirli Topraklardan İzole Edilmiş Mikroorganizmaların Biyoplastik Üretim Yeteneklerinin Belirlenmesi ve Biyoplastiğin Karakterizasyonu”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2012 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
14. ÇELİKDEMİR, M., “Hidrokarbon Kirliliği Bulunan Topraklardan İzole Edilen Mikroorganizmalar ile Biyosürfektan Üretimi” Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2012 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK).
15. CENGİZ, G., “Manyetik Trametes versicolor Biyokütlesi İle Boyar Madde Giderimi”, Biyosürfektan Üretimi” Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2013 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. AHMET ÇABUK; YRD. DOÇ. DR. MESUT ŞAM).
16. YILDIRIM, S., “Hidrokarbonla Kirlenmiş Topraklardan İzole Edilen Bakterilerden Pigment Üretimi”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2014 (DANIŞMAN: PROF. DR. AHMET ÇABUK; İKİNCİ DANIŞMAN:YRD. DOÇ. DR. PINAR AYTAR).
17. YARDIMCI, E., “Geobacillus subterraneus ile proteaz üretimi”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2014 (DANIŞMAN: PROF. DR. AHMET ÇABUK; İKİNCİ DANIŞMANYRD. DOÇ. DR. PINAR AYTAR).
18. SABANCI S., "Mikrokristalin selüloz ve odun unu ilaveli polihidroksibütirat (PHB) kompozitlerinin solvent yöntemiyle hazırlanması ve karakterizasyonu", Bartın Üniversitesi, 2015 (PROF. DR. SURHAY ALLAHVERDİ; İKİNCİ DANIŞMAN: PROF. DR. AHMET ÇABUK)
19. ERDÖNMEZ, O., “Eynal termal kaplıcasının prokaryotik çeşitliliğinin belirlenmesş ve proteaz üretim yeteneklerinin değerlendirilmesi, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2015 (DANIŞMAN:PROF. DR. AHMET ÇABUK).
20. BOZKURT, D., “Bor İçeren Ortamlarda Prokaryotik Çeşitliliğin Belirlenmesi”, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2016 (DANIŞMAN:PROF. DR. AHMET ÇABUK).
21. KATAR Ş. "Asidik maden drenajından izole edilen Talaromyces aculetus ile bazı boyarmaddelerin biyosorpsiyonu" Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2016 (DANIŞMAN: YRD. DOÇ DR PINAR AYTAR ÇELİK.).
22. SUNGUROĞLU C., "Hyaluronik asit sentaz geninin Lactococcus lactis'te ekspresyonu" Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2016 (DANIŞMAN:YRD DOÇ. DR. PINAR AYTAR ÇELİK).
23. ÇAKMAK H., "Ramnolipid Üretiminde Farklı Solvent Ekstraksiyon Stratejilerinin Değerlendirilmesi " Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2017 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. PINAR AYTAR ÇELİK).
24. KARAKAŞ, S., “Bor İçeriği Yüksek Maden Toprağının Toksik Etkilerinin Farklı Yöntemlerle Araştırılması” Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2017 (PROF. DR. AHMET ÇABUK; İKİNİC DANIŞMA: ÖĞR. GÖR. DR. FERHAN KORKMAZ).
25. ŞENER, B., “Kömür Kükürt Gideriminde Drum Tipi Biyoreaktör Uygulamaları” Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2017 (DANIŞMAN: PROF. DR. AHMET ÇABUK).
26. ABUTAHA A.,  "Manyetik Fungal Biyokütle ile Boyar Madde Biyosorpsiyonu" Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2020 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. PINAR AYTAR ÇELİK).
27. VATANSEVER Ö. "Kalsit biyoflotasyonunda deniz ve şebeke suyunun karşılaştırılması" Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2022 (DANIŞMAN: PROF. DR. AHMET ÇABUK).
28. BARUT D., "Halofillerin adaptasyonunda ekstrasellüler veziküllerin rolü" Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2022 (DANIŞMAN: DOÇ. DR. PINAR AYTAR ÇELİK; İKİNCİ DANIŞMAN:DOÇ.DR. BURAK DERKUŞ).
29. ATAR M. "Karboksidotrofik mikroorganizmaların izolasyonu, tanımlanması ve kullanılabilirliği"Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2023 (DANIŞMAN:PROF.DR. AHMET ÇABUK; İKİNCİ DANIŞMAN: ARŞ. GÖR. DR. BELMA NURAL YAMAN).
30. TAZEASLAN A"Tekstil boya maddelerinin gideriminde kullanılabilecek mikrobiyal preparatların geliştirilmesi"Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2023 (DANIŞMAN:PROF.DR. AHMET ÇABUK; İKİNCİ DANIŞMAN:DR. SERAP GEDİKLİ).
31. ÇOLAK B., "Mikroenkapsüle probiyotik preperatlar için konsorsiyum geliştirilmesi"Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2023 (DANIŞMAN:PROF.DR. AHMET ÇABUK; ).
32. TURAN GG., "Gıda sektörü için biyoaktif ve biyobozunur özelliklere sahip kompozit filmlerin geliştirilmesi"Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2024 (DANIŞMAN:PROF.DR. PINAR AYTAR ÇELİK; İKİNCİ DANIŞMAN: ÖĞR. GÖR. DR. ÖZLEM ERDAL ALTINTAŞ).